De computerhacker Neo (Keanu Reeves) komt op een vreemde manier in contact met Morpheus, die hem kennis laat maken met de echte wereld. De wereld die we kennen is volgens Morpheus een virtuele wereld, de Matrix genaamd. Morpheus gelooft dat Neo de enige is die de Matrix kan vernietigen om de mensheid z'n vrijheid weer terug te geven.